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    MeV 软件做热图 | 科研黑眼圈克星!
    发布时间:2020-04-24 浏览次数:15956
    MeV软件做热图|科研黑眼圈克星!

    刚开学,是否就被老板叫去


    随之而来就是渐渐加深的黑眼圈


    小编这里有一个方子

    就连黑眼圈都木有了

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    快速拯救你的秀发


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    热图小工具直 -MEV(Multiple Experiment Viewer)


    01、 软件安装

    Mev 软件官网下载 http://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mev-tm4/,无需安装,解压后,双击 TMEV.exe 即可,但是需要在使用该软件之前安装 JAVA。

    02、 软件使用

    准备数据

    如下图,首列是 gene symbol,geneID 或者 probe,后边是每个样本的信号值 / 测序 FPKM 值。


    打开软件

    选择 file——load data——browse——选择数据打开——Load 数据

    对样本按行进行归一化

    adjust data---Gene/Row Adjustments---Normalize Gene/Rows



    聚类

    选择 HCL(层次聚类)





    聚类完结果,点左侧 HCL1,点 HCL tree




    参数调整

    调整 1——颜色





    调整完



    调整 2

    在界面右击,选择红色方框的选项,设置去掉红色圈中标志



    调整 3

    设置图形大小

    设置每个条形的宽高



    03、 导出图片

    选择 tiff 格式,对图片命名,保存




    得到的热图



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