好不容易拿到了自己的空间转录组数据，心情激动、跃跃欲试，想赶快去实施一下自己的idea，可是又不会写代码，只能干等着？当然不是，其实你完全可以实现不写代码完成自己大部分数据挖掘的工作。

在胚胎发育过程中，造血干细胞（HSCs）需要迅速分化为成熟的血细胞。当前主要通过小鼠和体外模型系统来了解胎儿造血干/祖细胞（HSPCs）。研究表明在发育过程中，胎儿的造血功能包括不同器官中稀有造血干细胞的分化、迁移。人类确定性造血作用始于背主动脉造血簇中HSCs的出现，这些HSCs在4 PCW首先定位于胎儿肝脏并进行扩张，在10.5 PCW时，造血部位转移至骨髓并建立成人造血功能。

扎根于细胞生物学领域40余年，BD公司在流式和抗体领域占据着主导地位。作为目前单细胞研究常用的技术之一，BD公司2018年推出的Rhapsody™单细胞分析平台克服了传统检测的局限性，能够对上万个单细胞的数千个表达基因同时进行定量检测，鉴定和表征新型和罕见细胞类型，有助于理解从免疫学到肿瘤学等多个领域的生物学过程。

尽管转录组研究已经获得很多令人激动的进展，但它终归还是一个高度协调的、受表观基因组调控的基因表达程序的副产物。

研究人员使用空间转录组测序技术(spatial transcriptome，ST)来识别,阻断肿瘤异质性的来源，提供识别新的生物标志物的能力，并深入了解肿瘤细胞、脂肪组织、血管、三级淋巴结构和TME间基质之间的动态相互作用。

过往研究报道了早期胎儿肠上皮细胞动力学与IBD之间的联系，提示IBD患者的肠上皮中可能重现了类似于胎儿的转录程序。因此，解读肠道发育是预防和治疗此类疾病的关键一步。

DNA甲基化标志物作为标志物的成功案例有MGMT启动子甲基化可预测胶质母细胞瘤和血浆中甲基化SEPTIN 9(SEPT9)检测无症状结直肠癌，这些都已被纳入临床指南并转化为商业化临床试验。

识别人体器官细胞的特征及其相互作用对研究与疾病相关的生物学机制具有重要意义。

拟时序分析（pseudo-time），它指通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程。用于拟时序分析的软件和算法很多，目前文章中用到多的是Monocle软件，这也是是CNS主流期刊的常用软件。

微生物组与代谢组的数据整合方法按照是否基于已有知识可以分为统计学检验方法和知识驱动的整合分析方法。