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    ceRNA 调控网络

    Demo 结果

    DEMO 结果

    DEMO 结果 2

    结果解读

    顺利获得展示不同基因的 ceRNA 的调控机制,从中挖掘出实验组与对照组不同类型的 ceRNA 机制,找到特异性的 ceRNA。线代表不同的 microRNA,蓝色为 mRNA,红色为 circRNA,绿色为 lncRNA。


    ceRNA 调控网络介绍

    建立了一个计算的机制来使 circRNA(lncRNA) 作为 ceRNA 来保护 mRNA 不受 miRNA 的降解。基于基因的表达值,顺利获得回归模型分析以及种子序列的匹配的方法,建立 microRNA 的海绵吸附作用的调控网络。

    分析要求

    1、客户需要给予 microRNA 表达数据(可选),circRNA(lncRNA) 表达;

    2、数据(必选),mRNA 表达数据(必选);

    3、每组数据 3 个或 3 个以上生物学重复。

    给予结果

    1、图片文件(Network 图),包括 png、PDF 格式;

    2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打开进行细节调整;

    3、文本文件:基因之间 ceRNA 调控关系,调控分数,circRNA(lncRNA)microRNA,mRNA 核心调控关系的排序。


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